由于用脾集落法未能证明淋巴细胞的发生，所以造血干细胞与淋巴细胞在发生学的关系，直到Wu等建立了放射诱导染色体标记技术后才逐步得到阐明。 

等用照射诱导小鼠骨髓干细胞染色体发生一定程度的畸变，做为标记，但又不影响其细胞分裂。将这种细胞输入另一照射小鼠体内后，可以重建其造血和免疫功能。

由于它们具有特殊的畸形染色体，因此在照射宿主体内，任何二种细胞只要它们有共同的标记染体，应表明它们是来自同一干细胞。由于在照射诱导条件下，骨髓细胞中分化程度不同的干细胞，可以产生不同类型的染色体畸变，所以通过核型分析就能检查不同细胞的共同前体细胞。

用上述方法，发现在受体小鼠骨髓细胞、脾集落形成细胞以及经植物血凝素（PHA）和脂多糖（LPS）等丝裂原刺激的体外培养脾细胞中，都发现了一种共同的标记染色体，这证明它们都是从供体骨髓中的多能干细胞分化而来，从而有力的证明了无论是髓系干细胞和淋巴细胞，都是来自共同的造血干细胞。

已证明在小鼠骨髓中存在有前驱T细胞（pro-T）和前驱B细胞（pro-B）。ProT进入胸腺后可发育分化为成熟T细胞，pro-B则在骨髓内发育分化为成熟B细胞。但尚未直接证明在小鼠骨髓中存在有淋巴系干细胞。虽然如此，多数学者认为淋巴系干细胞可能是存在的。其检测困难可能是由于数量太少，或是由于对照射过于敏感，在照射过程中被选择地排除了。

在小鼠骨髓中c-kit 细胞可分化为各种血细胞及T和B细胞，但如将胸腺内c-kit 细胞移植于小鼠体内，则丧失其分化为髓系细胞的能力，仍能分化为T和B细胞。提示这种胸腺c-kit细胞可能是淋巴系干细胞。